mercoledì 23 marzo 2016

tanto per non dimenticare........

Linfen, Cina : Los Angeles smog sarebbe considerato un 'buon giorno' rispetto al inquinamento atmosferico in Linfen ed è considerato il La ragione dietro l'inquinamento è accreditato per la produzione industriale e l'inquinamento automobile "città più inquinata del mondo.". L'aria qui è apparentemente così male che lasciare i vestiti fuori ad asciugare può trasformarli nero!
Il Great Pacific Patch Garage : principalmente costituito da rifiuti di plastica, un'isola più di due volte la dimensione del Texas e oltre trenta piedi galleggianti di profondità nell'Oceano Pacifico.
Rondonia, Brasile : Questa è la regione più disboscate della foresta pluviale amazzonica. Alberi in migliaia e migliaia di acri di territorio sono stati ridotti e bruciato. L'area, una volta verde è stato ora sostituito con il bestiame.
Fiume Yamuna : Anche se seri tentativi sono stati fatti dal governo per ripulirlo, il fiume Yamuna in India continua ad essere offuscata dai rifiuti. La città di New Dehli da sola contribuisce per circa 3.296 MLD di liquami al giorno. Un importo troppo per gli impianti di trattamento sottofinanziati da gestire.
La Oroya, Perù : La fonderia di piombo in questa città, gestito da una società nordamericana Doe Run, è responsabile per l'enorme quantità di piombo che ha inquinato la città. A proposito di tutti i bambini che vivono nel quartiere sono stati testati e non vi è stata condotta trovati nel loro sangue, a livelli molto inaccettabili.
Lago Karachay, Russia : La quantità di radiazione da scorie nucleari di dumping è così forte che una persona può ottenere una dose letale entro un'ora di essere nella zona. Il cancro è un problema enorme tra i lavoratori della centrale nucleare. Ci sono molti casi di difetti parto e leucemie nella zona circostante. Vi è anche una preoccupazione per quanto riguarda la diffusione di radioattività nelle zone lontane aria e l'acqua del fiume.
Spazio : L'uomo ha anche lasciato una enorme scia di inquinamento nello spazio; oltre 4 milioni di libbre di detriti spaziali e vari veicoli spaziali vacante attualmente orbitano intorno alla terra. Ciò ha sollevato enormi preoccupazioni per potenziali incidenti che possono causare i satelliti e la comunicazione al sicuro.

come potrebbe essere :https://youtu.be/14p_QwNVMts



lunedì 21 marzo 2016

Immunoterapia nella Lotta contro i Tumori

Risultati immagini per lotta al cancroPubblicato il 17 gen 2014Intervista al Prof. Michele Vaio su youtube :Immunoterapia nella Lotta contro i Tumori
http://www.medicinaeinformazione.com/
"Breakthrough of the year: Cancer Immunotherapy - T Cells on the attack". Questo il titolo del numero di dicembre di Science in cui si fa il punto sulle dieci più interessanti novità scientifiche. Ed in effetti l'immunoterapia come arma per sconfiggere il cancro anche se non si può proprio definire una novità sta prepotentemente assumendo il ruolo di quarta arma (dopo chirurgia, radioterapia e chemioterepia o farmaci biologici) nella battaglia contro il cancro. Le prime scoperte del legame fra tumori e sistema immunitario, che in alcuni pazienti reagisce bloccando la proliferazione tumorale mentre in altri non è in grado di attivarsi risalgono a diversi anni fa, ma negli ultimi tempi le terapie immunologiche si sono diffuse sempre più e i risultati incoraggianti fanno prevedere che nel futuro più prossimo vi sarà una ancora maggiore ricerca e applicazione dell'immunoterapia in abbinamento con la chemioterapia tradizionale, la chirurgia e la radioterapia. Parliamo di tutto questo con il Prof. Michele Maio, Direttore della Divisione di Immunoterapia Oncologica del Policlinico Santa Maria alle Scotte di Siena, uno dei centri più all'avanguardia in Italia per ricerca e cura dell'Immunoterapia che ci parla delle prospettive di utilizzo dei farmaci oggi a disposizione, di quali tipi di tumore reagiscono meglio all'immunoterapia - il melanoma ed il mesotelioma pleurico ad esempio - e delle sperimentazioni importanti su altri tumori come il tumore al polmone o il tumore al seno.https://youtu.be/JIRNcR_5GjM

Prevenzione e Genetica Oncologica nei Pazienti a RIschio
https://youtu.be/LJgQyGHR0bU
Pubblicato il 13 set 2013
http://www.medicinaeinformazione.com/
il Dott. Bernardo Bonanni,Direttore dellaDivisione di Prevenzione e Genetica Oncologica dell'Istituto Europeo di Oncologia IEO di Milanoci spiega cosa vuol dire avere fattori di rischio - familiari - come nel caso di mutazioni genetiche - personali - se si ha avuto già una precancerosi o un tumore - o legati a stili di vita sbagliati - alimentzzione sbagliata, fumo, obesità... - e come si può fare prevenzione con controlli mirati, farmacoprevenzione o profilassi chirurgica

sanita' che non funziona

Lecce, tac dopo 600 giorni alla malata di tumore: la ministra Lorenzin invia gli ispettori

domenica 20 marzo 2016

marina abramovich

Risultati immagini per marina abramovich

Marina Abramović è nato nel 1946 a Belgrado, figlio di due eroi nazionali dell'epoca di Tito, è stata una vita fuori di esperienza esistenziale . I tuoi genitori partigiani li educano con rigore militare e non sono in grado di dare amore. Mid-1960 lascia la famiglia del padre. La madre prende il controllo. Anche quando quasi 30 anni Marina ha essere a 22 ore a casa. Chiudere e il calore che riceve da sua nonna, che si apre anche la porta alla spiritualità. Dopo l'esperienza del collasso del sistema nel 1990, hanno scoperto il nomade e viaggiare per il mondo. L'esperienza del estremo è essenziale per loro. In tutto balcanico è estremamente "estrema tenerezza, estremo odio, violenza estrema". In uncolloquio con la rivista d'arte "arte" poco prima della grande retrospettiva chiamate antropologia, la natura e la filosofia come le loro influenze artistiche. L'universo di Abramovic si nutre di contemplazione e riflessione.Le persone che hanno scelto una vita lontano dalla convenzione sono spesso chiesto: Perché non avete figli? O: Che cosa vuoi di studiare l'arte comincia? Alcuni artisti si confrontano la loro vita con un grande punto interrogativo: è arte? Marina Abramović non ha sentito questi dubbi più a lungo, anche se questa domanda ha inaugurato oltre trent'anni di quasi tutte le interviste. La domanda non è chiesto perché la risposta finalmente è ovvia: Sì, il lavoro performativo di Abramovic d'arte.

Arte che afferra e sconvolto e si occupano di questioni di vita quotidiana come ispirato come la questione di chi siamo e perché facciamo quello che facciamo. L'arte di Abramovic risponde alla domanda di come il vivere una piena, presenza viva indipendente possibile: con onestà, disciplina, pazienza, passione, amore e una visione. "Chi ha visioni dovrebbero andare dal medico", dice l'ex cancelliere Schmidt. Sì! Chi ha delle visioni dovrebbero andare dal medico e di essere in grado di verificare che questa è l'essenza dell'arte.
"L'uomo ha due cose contro la paura: prima della sua mortalità e del dolore."

- Marina Abramović

liberta' ed arte

Neša Paripović, N.P. 1977, 1977,

Nesa Paripović, NP 1977 1977 video, comunicati stampa MOCAK
Nesa Paripović, NP 1977 1977 video, comunicati stampa MOCAK
Miroslaw Balka, BlueGasEyes 2004, video, comunicati stampa MOCAKCristina Lucas, Libertà guida il popolo (La Liberté ragionata), 2009, video, comunicati stampa MOCAKRobakowski, Tadeusz Junak, Richard Meissner, mercato 1970, video, comunicati stampa MOCAKU-u
Yves Klein, antropometria del periodo blu, 1960, video, moteriały rilascia MOCAK Sergei Bratkov, zuppe Jar, 2004, video, comunicati stampa MOCAK
.......................Il bisogno di libertà. arte europea dopo il 1945  è una edizione giubilare del progetto del Consiglio d'Europa. Dal 1954, gli organizzatori si sono posti il compito di presentazione ciclica di opere d'arte relative al patrimonio comune del Vecchio Continente. Essi sottolineano che ciò che costituisce le caratteristiche di una identità europea basata sui diritti umani universali derivate da storia europea. L'edizione di quest'anno del progetto è stato avviato da parte del Deutsches Historisches Museum di Berlino, dove ha anche tenuto la prima presentazione della mostra, che è stata visitata da allora Milano e Tallinn. L'ampio spettro di lavoro unisce le riflessioni di arte contemporanea europea sulla libertà.
l'edizione polacca è stata pesantemente modificata dalla curatrice polacca - Delfina Jałowik, Monika Koziol e Maria Anna Potocka.Coordinatore numero limitato di mostre, concentrandosi principalmente sul mezzo video.collezioni internazionali di opere della collezione sono uniti al museo di Cracovia, che comprendono, tra gli altri BlueGasEyes Miroslaw Balka o Bródno 2000 Pawel Althamer.Sebbene dominato dalle opere di artisti del blocco orientale, il bisogno di libertà è riuscito a raccogliere un impressionante elenco di 47 autori provenienti da 17 paesi europei.  Sembra molto rischioso prendere il tema della libertà - soprattutto in termini di politica e sociale - in un progetto coordinato e gestito da una delle più grandi istituzioni di governo.Molto probabilmente perché la mostra non troverà moderna controcultura voti sulla crisi economica e movimenti civili in Europa occidentale. La corrente critica politica e sociale appare forse solo nelle opere di artisti provenienti dall'ex Unione Sovietica. Suggestiva, Nikita Kadan lavoro interventi connessi con la ancora presenti nella parte orientale del problema della tortura, creativo arbitro vaso zuppa Sergei Bratkov mostrando le realtà estreme sembrano servire a sottolineare il divario tra le due estremità del continente.Paesi dell'Est diventano l'antitesi dell'Europa contemporanea occidentale. Naturalmente, non solo per la selezione della linea di demarcazione della cultura contemporanea. Mocakowska bisogno di libertà è soprattutto una riflessione di divergenti in due percorsi che si intersecano - la storia dal punto di vista della storia sociale e storia dell'arte.

Marina Abramović : preformance al moma , ma presa di mira



L'artista è sul wc: la performance dell'anti Marina Abramovich
"E' ora di finirla con queste cavolate". Parola di Lisa Levy, artista, attrice, comica e psicoterapeuta americana che ha deciso di spogliarsi in pubblico come reazione alla deriva egocentrica di buona parte del mondo dell'arte. Bersaglio dell'invettiva di Levy è la performer serba Marina Abramovic e la sua "The Artist is Present", performance andata in scena al Moma di New York nel 2010. L'artista, seduta immobile su una sedia all'interno di una grande sala vuota, si era messa a disposizione del pubblico ospitando uno alla volta gli spettatori nella sedia posta di fronte di lei per oltre due mesi. "L'ego e la pretenziosità hanno seriamente minato la qualità del lavoro nel mondo dell'arte", ha affermato Lisa Levy che individua nell'opera della Abramovich il simbolo di questa deriva. Levy ha così deciso di mettere in scena per due giorni dal 30 gennaio 2016 "The Artist is Humbly Present" (L'artista è umilmente presente), sua personale versione della rappresentazione della performance del 2010: nuda, seduta su un wc, ospiterà uno alla volta spettatori e curiosi sul sanitario posto di fronte al suo. "Sono così stanca delle cavolate trendy nel mondo dell'arte in questi anni - ha spiegato la donna  - e poi penso che stare nuda in pubblico sarà molto divertente". Non è la prima volta che lo spettacolo della Abramovich viene preso di mira dai comici; anche Virginia Raffaele, in Italia,  ha vestito i panni dell'artista serba in occasione di uno spettacolo andato in scena alla Biennale di Venezia 2015, e a lei si è ispirato l'attore Andrea Cosentino per lo spettacolo teatrale Not here Not now
 

Come nasce un farmaco

 a proposito di nuove terapie comparse su internet per la SM.  Risultati immagini per la nascita di un farmaco

 dal sito dell'AIFA  , agenzia governativa ufficiale del farmaco  http://www.agenziafarmaco.gov.it/it/content/come-nasce-un-farmaco

Un farmaco è una sostanza o un’associazione di sostanze impiegata per curare o prevenire una specifica malattia.
Ma come si valuta se un medicinale è davvero efficace e, soprattutto, non arreca danni alla salute?
Per comprendere le sue proprietà, quantificare il rapporto tra gli eventuali rischi e i benefici che se ne traggono dalla sua assunzione, la molecola chimica che aspira a diventare un farmaco è sottoposta a una lunga serie di studi, condotti prima in laboratorio e su animali e poi sull’uomo. Queste ricerche, la cui durata oscilla in genere tra i sette e i dieci anni, sono a carico del “proprietario” del farmaco (il più delle volte un’industria farmaceutica) e si articolano in diverse fasi: studi “in vitro” e “in vivo” sugli animali (sperimentazione preclinica) e studi cosiddetti di fase 1, di fase 2 e di fase 3 eseguiti sull’uomo (sperimentazione clinica).  

La sperimentazione preclinica

Questa fase della sperimentazione è utile per osservare come si comporta e qual è il livello di tossicità della molecola su un organismo vivente complesso: quale è la via di somministrazione, come viene assorbita e successivamente eliminata.
Inizialmente sono eseguiti gli studi “in vitro” al fine di comprendere le caratteristiche della molecola chimica da cui si ritiene di poter ricavare un farmaco. In pratica, la sostanza viene messa in provetta insieme a colture cellulari o a microrganismi e sottoposta a una serie di test. Questi esperimenti vengono eseguiti in laboratori altamente specializzati.

Soltanto quando si è appurato in laboratorio che la molecola possiede potenziali effetti terapeutici si può passare alla sperimentazione sugli animali (studi “in vivo”).

Fase 1

Ha inizio con lo studio di fase 1 la sperimentazione del principio attivo sull’uomo che ha lo scopo di fornire una prima valutazione della sicurezza e tollerabilità del medicinale.In genere, questi studi sono condotti in pochi centri selezionati, su un numero limitato di volontari sani, in età non avanzata, per i quali è documentata l’assenza e valutata la non predisposizione a malattie. L'obiettivo principale è la valutazione degli effetti collaterali che possono essere attesi considerando i risultati delle precedenti sperimentazioni sugli animali e la valutazione della modalità di azione e distribuzione del farmaco nell’organismo.

I volontari vengono divisi in più gruppi, ciascuno dei quali riceve una diversa dose di farmaco (in genere crescente), per valutare gli eventuali effetti indesiderati della sostanza in relazione alla quantità somministrata. Se oggetto della sperimentazione sono gravi patologie (per esempio tumori, AIDS, eccetera), questi studi possono essere condotti direttamente su pazienti che ne sono affetti e per i quali il farmaco è stato pensato.

Fase 2

Nello studio di fase 2 (definito anche terapeutico-esplorativo) comincia ad essere indagata l’attività terapeutica del potenziale farmaco, cioè la sua capacità di produrre sull’organismo umano gli effetti curativi desiderati. Questa fase serve inoltre a comprendere quale sarà la dose migliore da sperimentare nelle fasi successive, e determinare l’effetto del farmaco in relazione ad alcuni parametri (come, ad esempio, la pressione sanguigna) considerati indicatori della salute del paziente.Negli studi di fase 2 la sostanza è somministrata a soggetti volontari affetti dalla patologia per cui il farmaco è stato pensato. I soggetti “arruolati” per lo studio vengono generalmente divisi in più gruppi, a ciascuno dei quali è somministrata una dose differente del farmaco e, quando è eticamente possibile, un placebo (vale a dire una sostanza priva di efficacia terapeutica) Per evitare che la somministrazione del placebo influenzi le aspettative dei partecipanti, le valutazioni dei parametri di attività e sicurezza sono condotte senza che paziente (si parla così di studio in cieco singolo), o medico e paziente (studio in doppio cieco), conoscano il tipo di trattamento ricevuto o somministrato.Questa fase dura circa un paio d'anni. Questa seconda fase è utile quindi a dimostrare la non tossicità e l’attività del nuovo principio attivo sperimentale.
Ci sono però ancora altri quesiti a cui bisogna dare una risposta: ma il farmaco quanto è efficace? Ha qualche beneficio in più rispetto a farmaci simili già in commercio? E qual è il rapporto tra rischio e beneficio?

Fase 3

A tutte queste domande si risponde con lo studio di fase 3 (o terapeutico-confermatorio). In questo caso non sono più poche decine i pazienti “arruolati”, ma centinaia o migliaia. L’efficacia del farmaco sui sintomi, sulla qualità della vita o sulla sopravvivenza è confrontata con un placebo (sostanza priva di efficacia terapeutica), con altri farmaci già in uso, o con nessun trattamentoLa tipologia di studio di riferimento in questa fase è lo Studio clinico controllato randomizzato.Si tratta di un tipo di studio in cui ai pazienti viene assegnato casualmente (in inglese random) il nuovo principio attivo o un farmaco di controllo (in genere il trattamento standard per quella specifica patologia oggetto della ricerca).
Lo studio clinico controllato randomizzato è molto affidabile nel definire l’efficacia di un medicinale. Infatti, l’attribuzione casuale del nuovo farmaco o del farmaco di controllo garantisce che i due gruppi siano simili per tutte le caratteristiche salvo che per il medicinale assunto. Dunque, alla fine della sperimentazione, sarà possibile attribuire ogni differenza nella salute dei partecipanti esclusivamente al trattamento e non a errori o al caso.
Durante questa fase vengono controllate con molta attenzione l'insorgenza, la frequenza e gravità degli effetti indesiderati. La durata della somministrazione del farmaco è variabile a seconda degli obiettivi che la sperimentazione si pone, ma in genere dura dei mesi. Il periodo di monitoraggio degli effetti del farmaco è invece spesso più lungo, arrivando in qualche caso a 3-5 anni.

un esempio  http://www.agenparl.com/seven-to-stand/

....Terni, Seven to Stand: cura italiana efficace contro sclerosi multipla ed artrite reumatoide

nuove terapie per fermare il melanoma mirano a una combinazione di più approcci, tra cui la regolazione del ciclo di vita delle cellule

....................In questo scenario, cercare approcci alternativi diventa essenziale, come dimostra uno studio pubblicato su Molecular Cell che mette in luce l’importanza di una regolazione epigenetica nello sviluppo del melanoma. La ricerca si è concentrata sulle interazioni molecolari di una proteina espressa a livelli molto alti nei pazienti affetti da questi tumori, e associata a un maggiore tasso di mortalità. Silenziare questa molecola, hanno scoperto i ricercatori, potrebbe rendere le cellule più sensibili alla chemioterapia.
Per capirne di più, abbiamo parlato con Chiara Vardabasso, ricercatrice italiana presso la Ichan School of Medicine al Mount Sinai di New York e autrice che firma a primo nome questo studio.
Cosa significa “regolazione epigenetica” e qual è il protagonista della vostra ricerca?
La definizione ufficiale di epigenetica è qualsiasi cambiamento a livello di espressione dei geni che però non è scritto nel DNA ma dipende dalle modificazioni della cromatina. La cromatina è una struttura formata da DNA e da particolari proteine chiamate istoni: in pratica il DNA si attorciglia attorno agli istoni e solo così può essere contenuto all’interno di una cellula.
Ecco, il nostro lavoro non ricerca mutazioni a carico di geni che possono accelerare la progressione del melanoma ma si occupa appunto delle modificazioni epigenetiche.
Il protagonista della nostra ricerca è un particolare istone, chiamato H2AZ2, che è espresso a un livello più alto nei pazienti con melanoma ed è associato a una prognosi peggiore per questi soggetti.
La vera domanda a questo punto è: cosa fa questa proteina, perché ce n’è di più nei pazienti con melanoma?
Abbiamo scoperto che il suo ruolo è quello di regolare il normale ciclo di vita di una cellula, accelerando la crescita e la proliferazione delle cellule del melanoma. In pratica, una cellula che ne ha di più ha un vantaggio rispetto alle altre, può moltiplicarsi più velocemente e quindi è in grado di guidare la crescita tumorale.
Non mi stupirebbe se H2AZ2 avesse un ruolo anche in altri tipi di tumori, ma non ci sono ancora evidenze al riguardo. In realtà questa proteina non è mai stata presa in considerazione finora, la vera protagonista in letteratura è l’altra isoforma, H2AZ1. Spero che l’uscita del mio lavoro invogli altri gruppi a studiare questa molecola in diversi tipi di cancro.
Quindi se si potesse eliminare questo istone si potrebbe rallentare la crescita del tumore e curare pazienti affetti da melanoma?
Sì certo, anzi questo è l’aspetto del mio lavoro che mi piace di più, quello delle potenziali applicazioni cliniche intendo. Non voglio dare false informazioni o speranze ai pazienti però, gli esperimenti che abbiamo condotto noi sono tutti in vitro e quindi il nostro è un lavoro di ricerca di base abbastanza lontano dalle reali applicazioni cliniche. Certo è che i risultati sono incoraggianti e il prossimo passo sarebbe quello di fare degli esperimenti in vivo, su modelli di topo e modelli di melanoma, e poi eventualmente si potrebbe arrivare a una fase preclinica.
Non avete avuto nessun contatto con i tessuti di pazienti con melanoma?
Al contrario. È vero che la sperimentazione è stata fatta in vitro ma il punto di partenza, fondamentale per noi, sono stati proprio i pazienti. Questa è la cosa bella del Mount Sinai: lavorando in un ospedale, collaboriamo con dermatologi e chirughi e abbiamo accesso aicampioni di pelle dei pazienti trattati. Abbiamo perciò collezionato un grande numero ditessuti di melanoma con i quali siamo riusciti a costruire una vera e propria banca.
Per gli esperimenti, siamo prima partiti dalle cellule in vitro e poi abbiamo avuto l’opportunità di testare i nostri risultati in vivo su cinquanta campioni di tessuto, quindi una cosa sicuramente significativa. E abbiamo confermato che anche in vivo c’è un aumento di H2AZ2: è stato importante vedere che davvero i soggetti con melanoma ne producono di più.

Quali sono le prospettive future del suo lavoro?
Le prospettive sono varie. La nostra ricerca ci ha portato a identificare un’altra proteina, che si chiama BRD2, che si lega a H2AZ2 e pensiamo possa avere un ruolo importante nello sviluppo del tumore. Penso che i miei studi punteranno a capire il ruolo di questa molecola. È una cosa che mi interessa davvero molto perché esistono già delle molecole usate in clinica che inibiscono BRD2 e si tratta sempre di una regolazione epigenetica. In questo campo ci sono ricerche avanzate, soprattutto per quanto riguarda le leucemie, ma ci sono alcuni studi in vivosull’uso di queste molecole anche per il melanoma.
Sempre melanoma dunque…
Sì sì, melanoma. È il momento giusto per studiare questo tipo di tumore perché è un argomento caldo in questi ultimi anni.
Quattro anni fa, sono usciti due studi (ndr. questo e questo) su una nuova terapia cosiddetta mirata, cioè che va a inibire uno specifico gene, una specifica proteina. Il bersaglio era una proteina chiamata BRAF, mutata nel 60% dei melanomi. I pazienti metastatici trattati con inibitori di BRAF in 6 mesi hanno avuto una regressione totale del melanoma, un risultato spettacolare. Purtroppo però questi pazienti hanno avuto ricadute perché il melanoma aveva sviluppato resistenza a questi farmaci. Ora ci sono moltissime ricerche volte a scoprire perché e come si è sviluppata questa resistenza.
Comunque le nuove strategie terapeutiche puntano molto sulla combinazione di diversi farmaci e la nostra scoperta su H2AZ2 potrebbe essere usata assieme agli inibitori BRAF per rallentare e inibire i meccanismi di resistenza.

in che modo la cromatina controlla l’espressione dei geni in una cellula?

l.m. : queste ricerche (e' vergognoso che non si dia la possibilta' di farle in Italia)sono molto importanti. La faffricazione di proteine anomale induce una reazione autoimmune che puo' essere molto dannosa , addirittura invalidante.

spettrometro di massa

La cromatina è costituita da RNA, DNA e proteine, si trova all’interno del nucleo in forma libera non circondata da membrane e può avere una conformazione più o meno condensata. Quando è molto impaccata, è inaccessibile a tutti i vari enzimi e fattori coinvolti nella replicazione e nella trascrizione del DNA; quando la sua struttura è più allentata, allora i geni sono attivi. Il grado di condensazione viene influenzato da una serie di modificazioni che noi chiamiamo epigenetiche, perché cambiano l’attività di un gene senza colpirne la sequenza di DNA. Proprio come ogni organismo ha una propria sequenza di basi azotate, così tutti i tipi di cellule hanno un profilo distintivo di modificazioni epigenetiche, in ciascuna fase del loro sviluppo. Questo vale anche per le patologie: ormai è ampiamente accettato che alcune malattie dipendono non tanto da una mutazione all’interno del DNA quanto da cambiamenti appunto epigenetici, come la metilazione o le modificazioni alle proteine della cromatina.
Il mio lavoro è focalizzato proprio sulle proteine coinvolte nella formazione della cromatina, in particolare quali sono e come variano durante il ciclo cellulare. È importante studiarle perché sono gli strumenti attraverso i quali il DNA esegue la sua funzione e se il ciclo cellulare è deregolato, si può avere la formazione di un tumore.
Quali sono le tecniche di analisi della cromatina?
Le proteine si studiano attraverso la proteomica. In particolare, quando si vogliono identificare tante proteine nello stesso momento si utilizzano degli strumenti chiamati spettrometri di massa. Se invece vogliamo capire la quantità di una certa proteina e magari fare un confronto tra stato patologico e normale, dobbiamo usare metodi quantitativi. Il più famoso si chiama SILAC (Stable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture): si parte da due tipi diversi di cellule in coltura, per esempio normali o provenienti da un paziente. In un caso aggiungiamo nel terreno di crescita degli amminoacidi normali mentre nell’altro amminoacidi marcati con isotopi non radioattivi, che hanno un peso diverso rispetto ai primi. Man mano che le cellule crescono, incorporano amminoacidi e danno origine a proteine più o meno pesanti a seconda che provengano, per esempio, dalle cellule malate o da quelle normali. Grazie al diverso peso, lo spettrometro di massa è in grado di distinguerle, identificarle e di dirci se c’è qualche proteina differenzialmente espressa. Si possono analizzare migliaia di proteine contemporaneamente, ci sono spettrometri che risolvono anche 5 mila proteine in 2-3 ore.

Come mai è così difficile studiare la cromatina?
Il problema principale è riuscire a estrarla dalla cellula e poi, ovviamente, averne una buona quantità. La cromatina è come il velcro, attacca un sacco di proteine che magari non c’entrano nulla con il processo che ci interessa. Pensiamo a quelle citoplasmatiche o anche al nucleo stesso, in cui ci sono tante proteine solubili che magari normalmente fanno parte della cromatina ma nell’istante considerato non interagiscono col DNA. C’è il rischio di portarsele dietro come contaminazione o, al contrario, di perdersele durante l’estrazione.
Inoltre la cromatina è elettricamente carica e potrebbe non essere solubile e precipitare nei solventi classici.
Durante il mio dottorato a Edimburgo, abbiamo messo a punto un metodo per purificare la cromatina e capire come cambia durante il ciclo cellulare.
Abbiamo fatto uno screening con un numero enorme di proteine, derivanti da 50-70 esperimenti diversi: prima le abbiamo identificate e poi, tramite analisi informatica, abbiamo fatto una predizione sulla loro funzione. Abbiamo usato un metodo di machine learning, o apprendimento automatico, con l’algoritmo chiamato random forest. L’analisi ha seguito il metodo guilt by association, che in italiano sarebbe associazione a delinquere ma non suona tanto bene. L’idea è fornire all’algoritmo tutta una serie di proteine che sappiamo far parte della cromatina e che hanno una certa funzione. Quando l’algoritmo ha imparato a riconoscerle, gli facciamo analizzare un insieme di altre proteine, sconosciute, alla ricerca di quelle simili a quelle di partenza. Così facendo abbiamo stilato un elenco di molecole che con buona probabilità sono coinvolte nella formazione della cromatina ma la cui funzione resta un mistero. Una cosa controversa, a cui non sono ancora riuscita a dare una risposta, è che ci sono proteine la cui funzione sembra addirittura non essere correlata alla cromatina. Per ora abbiamo ipotizzato che potrebbero essere proteine di supporto o anche autostoppiste, che si attaccano al DNA semplicemente perché è carico negativamente e loro sono positive.
Quali sono le prospettive future del tuo lavoro?
Di solito, gli screening di questo genere si focalizzano su una singola proteina oppure su un particolare processo. Quello che sto cercando di fare io è guardare più nel dettaglio, cioè considerare solo piccole sequenze di DNA e vedere quali proteine vi si legano. Attualmente non ci sono ancora dei metodi per analizzare una particolare sequenza e vedere tutto quello che vi si lega.
Dal punto di vista pratico, il problema è riuscire a purificare un pezzo di DNA cortissimo, lungo circa 500 paia di basi, magari è presente una sola volta in tutto il genoma. La mia idea è usare il sistema CRISPR e sfruttare Cas9 come esca per isolare la sequenza di interesse.
Il passaggio limitante è avere abbastanza materiale di partenza, perché se ci vogliono ettolitri di cellule è impensabile che qualcuno ci faccia ricerca. Quindi i due punti cruciali per questo tipo di studio sono: innanzitutto mettere a punto un protocollo per arricchire il più possibile il campione e ridurre la quantità di cellule di partenza; contemporaneamente, sviluppare degli spettrometri di massa sempre più potenti con cui riuscire ad analizzare quantità anche minime di proteine.........

da wikipedia cos'e' lo spettrometro dimassa

Il principio su cui si basa la spettrometria di massa è la possibilità di separare una miscela di ioni in funzione del loro rapporto massa/carica generalmente tramite campi magnetici statici o oscillanti. Tale miscela è ottenuta ionizzando le molecole del campione, principalmente facendo loro attraversare un fascio di elettroni ad energia nota. Le molecole così ionizzate sono instabili e si frammentano in ioni più leggeri secondo schemi tipici in funzione della loro struttura chimica.

Il diagramma che riporta l'abbondanza di ogni ione in funzione del rapporto massa/carica è il cosiddetto spettro di massa, tipico di ogni composto in quanto direttamente correlato alla sua struttura chimica ed alle condizioni di ionizzazione cui è stato sottoposto.


Leggi anche: Una strategia epigenetica per combattere il melanoma

Pubblicato con licenza Creative Commons Attribuzione-Non opere derivate 2.5 Italia.
Nome: Cristina Furlan


Età: 33 anniNata a: Colle Umberto (TV)
Vivo a: Arnhem (Paesi Bassi)
Dottorato in: Biologia cellulare (Edimburgo, Regno Unito)
Ricerca: Purificazione della cromatina per analisi proteomica.
Istituto: Radboud University (Nijmegen), University of Edinburgh (Edimburgo)